Il y a des millions d'années, la tectonique des plaques terrestres a fait surgir les rochers de Tsodilo. C'est sur ce support résistant au temps et à l'érosion que les premiers hommes ont représenté leurs activités, leur culture et leurs croyances. Ces expressions artistiques, vestiges d'une évolution environnementale et humaine millénaire, éclairent l'origine lointaine de l'humanité.
Actuellement, le site est administré par le Musée national du Botswana.
Ce site, parfois appelé le « Louvre du désert », est constitué d'un soubassement de roches quartzites antiques. Il est longé à l'est par des dunes recouvertes d'arbres et à l'ouest par le lit d'un lac fossilisé.
Les zones principales de Tsodilo sont estimées à 4 800 ha, tandis que les zones intermédiaires s'étendent sur 70 400 ha. Les sommets rocheux, communément nommés « inselberg », ont été baptisés en fonction de leur hauteur, de leur morphologie et de leur alignement dans l'espace : on distingue ainsi les curieux noms de Mâle, Femelle, Enfant et PetitEnfant. Le plus haut sommet du Tsodilo, 400 mètres au-dessus du niveau de la mer, est également le plus élevé de tout le pays.
Le Tsodilo abrite des grottes comportant des traces d'occupation continue depuis l'Âge de la pierre. Les peintures rupestres représentent, parfois avec des proportions exagérées, du gros gibier et plus tard des animaux domestiques. On trouve également des dessins géométriques auxquels on attribue des significations religieuses.
La plupart de ces ?uvres ont été réalisées avec de l'ocre rouge, sauf une petite partie peinte en blanc.
Malgré le fait que l'on ignore la raison profonde de ces antiques réalisations artistiques, elles inspirent des créations actuelles, telles des émissions de timbres postaux.
Les écrits de Laurens van der Post, intitulés « The Lost World of the Kalahari », évoquent les monts de Tsodilo, en tant que lieu de culte hébergeant les esprits des ancêtres.
Le Tsodilo abrite des éléments remarquables qui ont permis de développer la recherche historique, géologique, archéologique et anthropologique.
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