Seules cinq îles ont une superficie supérieure à 500 km2 : les îles Santa Cruz, Isabela, San Salvador, San Cristobal et Fernandina. Les autres se nomment : Santa Maria, Marchena, Espanola, Baltra, Pinta, Rabida, Seymour, Darwin, Santa Fé, Pinson, Genovesa, Wolf, Turtuga et Bartolomé. Bien que situées sous l'Equateur, il règne sur ces îles un climat particulier : il ne pleut pas souvent et les températures ne sont pas très élevées. Un courant froid, dit « de Humbolt», qui favorise la production de plancton est à l'origine du développement d'une vie maritime abondante. Mais que ce soit dans la mer ou sur la terre, la faune des Galápagos est particulièrement originale : iguanes, tortues dont certaines peuvent atteindre un poids de 250 kg, manchots, phoques, requins blancs, différentes sortes de reptiles, lézards ou serpents, de très nombreux oiseaux et poissons. Les plantes les plus remarquables de l'archipel sont surtout les cactus et les figuiers de barbarie.
En 1835, le naturaliste anglais Charles Darwin (1809-1882) débarque sur l'île de San Cristobal, ou « Chatam » en anglais. Après une exploration de l'archipel, Darwin élabore sa théorie de l'évolution. Il avait remarqué que des animaux d'une même espèce présentaient des différences notables suivant le lieu où il vivait et la nourriture qu'il y trouvait (c'est le cas du pinson très présent dans les îles mais dont la forme du bec variait selon les endroits). A partir de ces observations, Charles Darwin rédige son ?uvre majeure « De l'origine des espèces par voie de sélection naturelle », publiée en 1859.
Vedettes de l'archipel, les tortues des Galápagos sont connues dans le monde entier.
Les iguanes et les tortues, sortes de descendants des animaux de la Préhistoire sont les animaux les plus célèbres de l'archipel. Les îles Galápagos sont un véritable paradis terrestre pour les amoureux de la nature.
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